Selected publications
2021
Kolanowski T., Wargocka-Matuszewska W., Zimna A., Cheda Ł., Zyprych-Walczak J., Rugowska A., Drabik M., Fiedorowicz M., Krajewski S., Steczek Ł., Kozanecki C., Rogulski Z., Rozwadowska N., Kurpisz M.,(2021). Multiparametric Evaluation of Post-MI Small Animal Models Using Metabolic ([18F]FDG) and Perfusion-Based (SYN1) Heart Viability Tracers.Int. J. Mol. Sci. 2021, 22(22). 
Lütge A., Zyprych-Walczak J., Brykczynska Kunzmann U., Crowell L.H., Calini D., Malhotra D., Soneson Ch., Robinson M.D.}, (2021). CellMixS: quantifying and visualizing batch effects in single-cell RNA-seq data. Life Sci Alliance 23;4(6)
Różańska-Zawieja J., Winnicki S., Zyprych-Walczak J., Szabelska-Beręsewicz A., Siatkowski I., Nowak W., Stefańska B., Kujawiak R., Sobek Z., (2021). The effect of feeding management and culling of cows on the lactation curves and milk production of primiparous dairy cows. Animals.11 (iss. 7), art. no. 1959.
2020
Weigt, D., Kiel A., Siatkowski I., Zyprych-Walczak J., Tomkowiak A., Kwiatek M., (2020). Comparison of the Androgenic Response of Spring and Winter Wheat (Triticum aestivum L.). Plants 9, 49.
Szenajch J., Szabelska-Beręsewicz A., Świercz A., Zyprych-Walczak J., Siatkowski I., Góralski M., Synowiec A., Handschuh L., (2020). Transcriptome Remodeling in Gradual Development of Inverse Resistance between Paclitaxel and Cisplatin in Ovarian Cancer Cells. International Journal of Molecular Sciences 21(23), 9218.
2019
Piekarska-Boniecka H., Rzanska-Wieczorek M., Siatkowski I., Zyprych-Walczak J., (2019). Controlling the abundance of the rose tortrix moth [Archips rosana (L.)] by parasitoids in apple orchards in Wielkopolska, Poland. Plant Protect. Sci., 55: 265–272.
Weigt, D., Niemann, J., Siatkowski, I., Zyprych-Walczak, J., Olejnik, P., Kurasiak-Popowska, D.}, (2019). Effect of Zearalenone and Hormone Regulators on Microspore Embryogenesis in Anther Culture of Wheat. Plants 8, 11, 487.
Różańska-Zawieja J., Szabelska-Beręsewicz A., Sobek Z., Zyprych-Walczak J., Siatkowski I., (2019). Assessment of heritability coefficient variation for various breeds of cattle. Journal of Animal & Plant Sciences 39(1), 6351-6358.
2018
Siatkowski, I., Zyprych-Walczak, J., (2018). R w analizie statystycznej dla przyrodników. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu, Poznań, Poland. ISBN 978-83-7160-899-5, ss.121.
Piekarska-Boniecka H., Zyprych-Walczak J., Siatkowski I., Dolańska-Niedbała E., Trzciński P., Rzańska-Wieczorek M., Tran Dinh D.}, (2018). The Impact of Apple Orchard Edge Plants on Communities of Pimplinae (Hymenoptera, Ichneumonidae). J. Entomol. Res. Soc., 20(2): 43–59.
Piekarska-Boniecka, H., Zyprych-Walczak, J., Rzańska-Wieczorek, M., Tran Dinh, D., Siatkowski, I., (2018). The number and abundance of ichneumonidae (Hymenoptera, Apocrita) subfamilies occurring in apple orchards and on their edges. Acta Sci. Pol. Hortorum Cultus, 17(2), 93–103. DOI: 10.24326/asphc. 2018.2.8.
Obrępalska-Stęplowska A., Zmienko A., Wrzesińska B., Goralski M., Figlerowicz M., Zyprych-Walczak J., Siatkowski I., Pospieszny H., (2018). The Defense Response of Nicotiana benthamiana to Peanut Stunt Virus Infection in the Presence of Symptom Exacerbating Satellite RNA. Viruses 10(9), 449.
Leśniewska A., Zyprych-Walczak J., Szabelska-Beręsewicz A., Okoniewski M. J., (2018). Genes sharing the protein family domain decrease the performance of classification with RNA-seq genomic signatures. iology Direct, 13 (1), 3, doi: 10.1186/s13062-018-0205-x.
2017
Piekarska-Boniecka H., Siatkowski I., Zyprych-Walczak J., Trzciński P., Rzańska-Wieczorek M., (2017). The phenology of occurrence of dominant predatory Syrphidae (Diptera) species in apple orchards and on their edges. Acta Sci. Pol. Hortorum Cultus, 16(1), 23–38.
Beręsewicz M., Alvarez A., Biecek P., Dyderski M. K., Kosiński M., Nowosad J., Rotter K., Szabelska-Beręsewicz A., Szymkowiak M., Wawrowski Ł., Zyprych-Walczak J., (2017). Conference Report: European R Users Meeting 2016. The R Journal, 9 (1), 501-504.
Różańska-Zawieja J., Szabelska-Beręsewicz A., Sobek Z., Nienartowicz-Zdrojewska A., Zyprych-Walczak J., Siatkowski I., (2017). Wpływ wielkości grup ojcowskich i stad na optymalną ocenę współczynnika odziedziczalności długości ciąży u bydła. Roczniki Naukowe Polskiego Towarzystwa Zootechnicznego 13(1), 9–17.
2016
Szenajch J., Góralski M., Świercz A., Szabelska A., Zyprych-Walczak J., Synowiec A., Siatkowski I., Handschuh L., (2016). Zmiany w ekspresji szlaków sygnałowych uczestniczące w wykształcaniu nabytej w obecności erytropoetyny oporności na ci-splatynę i paklitaksel w komórkach ludzkiego raka jajnika. {
2015
Zyprych-Walczak J., Szabelska A., Handschuh L., Gorczak K., Klamecka K., Figlerowicz M., Siatkowski I., (2015). The impact of normalization methods on RNA-seq data analysis. {}, Article ID 621690; doi: 10.1155/2015/621690.
2014
Gorczak K., Klamecka K., Szabelska A., Zyprych-Walczak J., Siatkowski I., (2014). Graphical methods for differential analysis of RNA-Seq data. Colloquium Biometricum} 44, 167-181.
2013
Uszczynska B., Zyprych-Walczak J., Handschuh L., Szabelska A., Kazmierczak M., Woronowicz W., Kozlowski P., Sikorski M. M., Komarnicki M., Siatkowski I., Figlerowicz M., (2013). Analysis of boutique arrays: A universal method for the selection of the optimal data normalization procedure. International Journal of Molecular Medicine}, 32 (3), 668-684. [IF = 1.957]
Tomkowiak A., Weigt D., Broda Z., Mikolajczyk S., Szabelska A., Zyprych J., Siatkowski I.,} (2013). Analysis of relationship between genetic and phenotypic similarity of alfaalfa mutants inflorescences. {} 7 (3) #34.
2012
Tomkowiak A., Weigt D., Szabelska A., Zyprych J., Broda Z., Siatkowski I. (2012). Analiza zróżnicowania genetycznego odmian I klonów koniczyny białej (Trifolium repens L.) z użyciem markerów RAPD Nauka Przyr. Technol. t. 6, z. 4, art. 79
Szabelska A., Zyprych-Walczak J., Siatkowski I., (2012). Application of linear mixed models in the selection of genes from microarray experiments with repeated measurements. Colloquium Biometricum} 42, 103-109.
2011
Okoniewski M. J., Lesniewska A., Szabelska A., Zyprych-Walczak J., Ryan M., Wachtel M., Morzy T., Schaeffer B., Schlapbach R. (2011). Preferred analysis methods for single genomic regions in RNA sequencing revealed by processing the shape of coverage. Nucleic Acids Research, doi: 10.1093/nar/gkr1249. [IF = 8.055]
Schmidt M., L. Handschuh, Zyprych J., Szabelska A., Olejnik-Schmidt A., Siatkowski I., Figlerowicz M., (2011). Impact of DNA microarray data transformation on gene expression analysis - comparison of two normalization method. Acta Biochimica Polonica} 58 (4), 573-580. [IF = 1.234]
Zyprych-Walczak J., Szabelska A., Siatkowski I. (2011). Application of statistical tests in gene selection problems. Biometrical Letters}, 48 (2), 113-121.
2010
Piekarska-Boniecka H., Siatkowski I., Zyprych J. (2010). Model for bionomy of privet sawfly (Macrophya punctumalbum L.) (Hymenoptera, Tenthredinidae). Acta Sci. Pol., Hortorum Cultus. - 9 (3), s. 161-166}
Piekarska-Boniecka H., Siatkowski I., Zyprych J. (2010). Comparison of the collecting of the parasitoids belonging to the Pimplinae subfamily (Hymenoptera, Ichneumonidae).Pol. Pismo Entomol. - vol. 79, no. 3, s. 283-290.
Siatkowski M., Szabelska A., Zyprych J., Weres J., Kujawa S. (2010). Growth curve functions in modeling the thin-layer drying of corn. Inzynieria Rolnicza 6 (124).
Thornton A., Szabelska A., Zyprych J. et. al.(2010). Modelling and Optimization of Algae Growth. Proceedings of the 72nd European Study Group - Mathematics with Industry}, 54-85.
Siatkowski I., Goszczurna T., Szabelska A., Zyprych J. (2010). Coefficients of dissimilarity and similarity with applications. Colloquium Biometricum} 40, p.13-23.
Szabelska A., Siatkowski M., Goszczurna T., Zyprych J. (2010). Comparison of growth models in R. Nauka Przyroda Technologia 4 (4) #50.